В состав центра входят научно-исследовательские отделы и научно-исследовательские лаборатории

• 41 НИО «Радиационная, химическая и биологическая защита»
• 42 НИО «Инженерно-технические мероприятия гражданской обороны и защиты от ЧС»
• 43 НИО «Развитие сети наблюдения и лабораторного контроля»
• 44 НИЛ «Средства индивидуальной защиты, радиационной и химической разведки и дозиметрического контроля»
• 45 НИЛ «Защитные сооружения гражданской обороны»
• 46 НИО «Управление правами на результаты интеллектуальной деятельности»
  

Основные направления деятельности научно-исследовательского центра:

• Научно-техническая деятельность в системе МЧС России в области обеспечения инженерной, радиационной, химической и биологической защиты населения
• Организация и выполнение мероприятий по обследованию и проектированию защитных сооружений ГО, созданию объектовых систем мониторинга состояния инженерных систем и конструкций зданий и сооружений (СМИС, СМИК)
• Разработка национальных и межгосударственных стандартов, устанавливающих требования к продукции ГО, ЗНТЧС и методам ее испытаний
• Научно-методическое сопровождение деятельности федеральных и территориальных подсистем сети наблюдения и лабораторного контроля гражданской обороны и защиты населения (СНЛК) с целью повышения эффективности их работы
• Участие в оценке способов и методов определения загрязненности (заражённости) объектов окружающей среды, продовольствия, питьевой воды, пищевого и фуражного сырья радиационными веществами, отравляющими веществами, аварийно-химически опасными веществами, биологическими средствами на территории Российской Федерации
• Организация правовой охраны РИД, создаваемых сотрудниками института